온라인 주문, 배달앱, 스마트스토어… 요즘 사장님들의 매출 채널은 하나가 아닙니다. 그리고 채널이 늘어날수록 어김없이 따라붙는 것이 바로 PG사(결제대행사) 수수료입니다. 매달 정산서를 받아도 '수수료가 왜 이만큼 나왔지?' 하고 고개를 갸웃한 적 있으시죠? 이 글에서는 PG사 수수료의 구조, 2026년 현재 적용되는 우대수수료율, 그리고 수수료 부담을 실제로 줄이는 방법까지 명확하게 정리해 드립니다.
PG사(결제대행사)란?
PG(Payment Gateway)사는 가맹점이 카드사와 직접 계약하지 않아도 신용카드·체크카드·간편결제·계좌이체 등 다양한 결제수단을 한 번에 처리할 수 있도록 연결해 주는 중간 사업자입니다. KG이니시스, 토스페이먼츠, NHN KCP, 나이스페이먼츠, 카카오페이 등이 대표적입니다.
오프라인 매장은 카드 단말기(VAN)를 통해 카드사와 연결되지만, 온라인 쇼핑몰·배달앱·앱 결제 등에서는 PG사가 결제 흐름을 통합 처리합니다. 이렇게 PG사를 통해 결제를 받는 사업자는 'PG사의 하위가맹점'이 됩니다.
PG사 수수료 구조: 뭐가 빠져나가는 걸까?
PG 결제 수수료는 크게 두 층으로 이루어집니다.
- 카드사 수수료(가맹점 수수료): 카드사가 결제 인프라 이용 대가로 청구하는 기본 수수료. 연매출 규모에 따라 우대수수료율 적용 대상이 됩니다.
- PG사 마진: PG사가 자체 결제 시스템 운영·보안·정산 서비스 제공 대가로 카드사 수수료에 추가로 붙이는 금액입니다.
사장님이 실제 부담하는 수수료 = 카드사 수수료 + PG사 마진입니다. PG사마다, 그리고 결제수단(신용카드·체크카드·간편결제)마다 요율이 달라지므로 계약 전 항목별 비교가 필수입니다.
2026년 현재 영세·중소가맹점 우대수수료율
정부(금융위원회)는 연매출 30억 원 이하 가맹점에 카드사 우대수수료율을 적용합니다. PG사 하위가맹점도 동일한 혜택을 받으며, 2026년 현재 적용 기준은 아래와 같습니다.
| 연매출 구간 | 신용카드 수수료율 | 체크카드 수수료율 |
|---|---|---|
| 3억 원 이하 (영세) | 0.4% | 0.15% |
| 3억~5억 원 | 0.6% | 0.25% |
| 5억~10억 원 | 1.1% | 0.85% |
| 10억~30억 원 | 1.45% | 1.15% |
| 30억 원 초과 (일반) | 카드사별 개별 협의 | |
2026년 기준 전체 신용카드 가맹점의 약 95.7%(약 309만 개)가 우대수수료율 적용 대상입니다. 우대수수료율은 별도 신청 없이 매반기 국세청 매출 자료를 기준으로 자동 적용됩니다.
📌 PG사 하위가맹점은 이용 중인 PG사를 통해, 또는 여신금융협회 '가맹점 매출거래정보 통합조회 시스템(cardsales.or.kr)'에서 현재 적용 수수료율을 직접 조회할 수 있습니다.
PG사 계약 전 반드시 확인할 사항
우대수수료율은 카드사 수수료 기준입니다. 사장님이 실제로 내는 금액은 여기에 PG사 마진이 더해지므로, 계약 시 다음 항목을 꼭 확인하세요.
- 결제수단별 최종 수수료율: 신용카드·체크카드·간편결제 각각 확인
- 월 이용료·초기 설치비: 일부 PG사는 월정액 또는 셋업 비용 별도 청구
- 정산 주기: D+1, D+2, 주 단위 등 PG사마다 상이하며 자금 흐름에 영향
- 취소·환불 시 수수료: 취소 건에 추가 수수료를 부과하는 경우도 있음
- 세금계산서 발행 방법: 수수료를 경비 처리하려면 증빙 서류가 필요
수수료 비용 처리와 매출 관리 팁
PG 결제대행수수료는 사업 관련 비용이므로, 세금계산서나 영수증을 받아 경비로 처리할 수 있습니다. 부가가치세 신고 시 매입세액공제 가능 여부도 세무사에게 확인하세요.
카드·배달앱·현금 채널별 매출과 수수료를 따로 기록해 두면 부가세·종소세 신고 때 누락 없이 반영할 수 있습니다. 오늘장부는 카드·현금·배달앱 매출을 한 화면에 기록하고 부가세 예상액을 자동 계산해 주므로, 정산일마다 흩어진 수수료를 일일이 합산하는 수고를 크게 덜 수 있습니다.
자주 묻는 질문
PG사 수수료와 VAN사 수수료는 어떻게 다른가요?
VAN사는 오프라인 카드 단말기 결제를 중계하는 사업자이고, PG사는 온라인·앱·비대면 결제를 중계합니다. 오프라인 단말기 결제는 VAN, 온라인 쇼핑몰이나 배달앱 등 비대면 결제는 PG사가 담당한다고 이해하면 됩니다. 요즘은 PG사가 오프라인 결제까지 통합 제공하는 경우도 늘고 있습니다.
배달앱 매출에도 PG 수수료가 따로 붙나요?
배달앱(쿠팡이츠·배달의민족 등)은 플랫폼 내에서 결제를 자체 처리하고 사장님에게 정산합니다. 카드 결제 수수료는 배달앱이 PG사와 계약하여 처리하므로 사장님이 별도로 PG사와 계약할 필요는 없습니다. 단, 배달앱이 청구하는 중개수수료(플랫폼 이용료)는 PG 수수료와 별개 항목이며, 배달앱별로 다르므로 각 플랫폼 고객센터에서 확인하세요.
신규 창업자는 우대수수료율을 바로 받을 수 있나요?
신규 가맹점은 첫 반기에는 카드사가 매출 자료를 확인하기 전까지 일반 수수료율이 적용됩니다. 이후 반기 매출이 확인되어 영세·중소 기준에 해당하면 우대수수료율을 소급 적용하고 수수료 차액을 환급받을 수 있습니다. PG사 하위가맹점은 이용 PG사를 통해 환급 일정을 확인하세요.
채널별 매출과 수수료를 한 번에 관리하고 싶은 사장님께, 오늘장부 무료로 시작하기를 추천드립니다.
※ 본 글은 2026년 기준 참고용 정보이며, 정확한 신고·금액은 국세청 홈택스 또는 세무사와 상담하세요.